知网查重在凌晨时段进行是出于对系统负荷的考虑，凌晨网站访问量较少，系统压力小，能够更快速、更稳定地进行查重操作。具体流程一般为，在凌晨12点至早晨6点这段时间内，登录知网账号，进入查重页面，上传待查文档，设置查重参数，点击开始查重按钮，系统开始对文档进行比对分析，待分析完成后生成查重报告，并提供相应的查重结果和相似度数据。

凌晨时段进行知网查重有利于提高查重效率和准确性。因为此时网络流量小，系统资源相对充裕，能够更快速地完成查重任务，同时也避免了高峰时段的等待和不稳定因素。另外，凌晨时段进行查重还能避免对正常工作和学习的干扰，提高工作效率。因此，合理安排时间，在凌晨进行知网查重是一个不错的选择。